Такие дозы антибиотиков действительно должны были убить все возможные половые инфекции, какими могли заразиться. Анализу ПЦР в такой ситуации вполне можно верить, и на данный момент на мой взгляд проблему можно закрыть. Вам стоит делать анализ методом ПЦР на все половые инфекции раз в полгода, как и любому человеку, ведущему половую жизнь. С другой стороны, не преувеличивайте значимость половых инфекций — это конечно неприятные заболевания, но ничего настолько страшного и пугающего в них нет.