Метод ПЦР обнаруживает ДНК бактерии, и положительный результат анализа методом ПЦР является доказательством наличия бактерии в организме. Анализ крови методом ИФА определяет наличие или отсутствие антител к определенной бактерии. Эти антитела появляются и исчезают по определенным законам, но вообще их поведение во многом индивидуально для каждого человека. И поэтому наличие или отсутствие антител не является доказательством наличия или отсутствия бактерии. На основании результатов метода ИФА крови можно делать лишь предварительные выводы, на основании ПЦР-диагностики вполне можно ставить окончательный диагноз.